Num tratamento de Reiki a energia flui desde as mãos do praticante para o corpo do cliente. O paciente usualmente está numa marquesa de massagem deitado, normalmente coberto com um lençol. O cliente mantém a sua roupa e nunca é necessário tirá-la. O praticante coloca as suas mãos suavemente perto do corpo da pessoa, em várias posições. Isso inclui posições perto da cabeça e ombros, do estômago e dos pés. Muitas outras posições podem ser usadas devido a específicas situações dos clientes. Em cada posição pode-se estar três a dez minutos dependendo de cada situação. Este tratamento pode durar 30 a 45 minutos ou mais.